یکی از مشکلات اساسی در زمینه پایاننامههای دانشگاهی چه در مقطع کارشناسی ارشد و چه دکترا، مساله کپی کردن از روی سایر پایان نامهها یا سرقت اطلاعات دیگر پایاننامهها بدون ذکر منبع است. البته صحبت کردن درباره موضوعی به این حساسیت آن هم در ارتباط با قشری که اعتباری فراوان نزد افکار عمومی دارد بسیار مشکل است، اما واقعیت این است که چنین مشکلی وجود دارد.حمید ضیاییپرور در وبلاگ«خبرنگار» نوشته است: به دلایل عدیده برخی از دانشجویان در مقاطع تحصیلات تکمیلی، به جای تحقیق بر روی رساله خود، موضوع را به فرد یا شرکتی که دستاندرکار این امر است واگذار کرده یا از طریق کپی کردن کامل یک پایان نامه دیگر از یکی از دانشگاههای کشور و تغییر اسم نویسنده و استادان داور و مشاور و راهنما آن را تحویل سیستم دانشگاهی میدهند.